MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rubrivivax gelatinosus IL144

Total Repeats: 161685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017075	GCC	2	6	87	92	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755860
2	NC_017075	CGC	2	6	120	125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755860
3	NC_017075	CG	3	6	254	259	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
4	NC_017075	GC	3	6	285	290	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
5	NC_017075	CCACG	2	10	306	315	20 %	0 %	20 %	60 %	383755860
6	NC_017075	CGG	2	6	335	340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755860
7	NC_017075	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755860
8	NC_017075	GC	3	6	490	495	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
9	NC_017075	GC	3	6	518	523	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
10	NC_017075	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755860
11	NC_017075	GCT	2	6	606	611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
12	NC_017075	TCA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755860
13	NC_017075	CGT	2	6	669	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
14	NC_017075	CGA	2	6	699	704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
15	NC_017075	CTG	3	9	733	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
16	NC_017075	CGA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
17	NC_017075	TTC	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755860
18	NC_017075	CGCA	2	8	775	782	25 %	0 %	25 %	50 %	383755860
19	NC_017075	GGA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755860
20	NC_017075	TTC	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755860
21	NC_017075	GCT	2	6	810	815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
22	NC_017075	GC	4	8	822	829	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
23	NC_017075	CAT	3	9	831	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755860
24	NC_017075	TGG	2	6	866	871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755860
25	NC_017075	CGA	2	6	876	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
26	NC_017075	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755860
27	NC_017075	AAG	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755860
28	NC_017075	CTT	2	6	1008	1013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755860
29	NC_017075	GC	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
30	NC_017075	GC	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
31	NC_017075	CG	3	6	1118	1123	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
32	NC_017075	CTG	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
33	NC_017075	AGA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755860
34	NC_017075	GAA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755860
35	NC_017075	CG	3	6	1251	1256	0 %	0 %	50 %	50 %	383755860
36	NC_017075	AAG	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755860
37	NC_017075	ACG	2	6	1345	1350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
38	NC_017075	TGC	2	6	1352	1357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755860
39	NC_017075	CGA	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
40	NC_017075	CAG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755860
41	NC_017075	AAC	2	6	1489	1494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017075	CTA	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017075	ACC	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017075	GCC	2	6	1689	1694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755861
45	NC_017075	TCG	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
46	NC_017075	GCG	2	6	1742	1747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755861
47	NC_017075	GTC	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
48	NC_017075	GAC	2	6	1808	1813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755861
49	NC_017075	CGG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755861
50	NC_017075	CGA	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755861
51	NC_017075	CGA	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755861
52	NC_017075	GC	4	8	1888	1895	0 %	0 %	50 %	50 %	383755861
53	NC_017075	GGT	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755861
54	NC_017075	GTC	2	6	1946	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
55	NC_017075	CGG	2	6	1976	1981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755861
56	NC_017075	GCCG	2	8	2009	2016	0 %	0 %	50 %	50 %	383755861
57	NC_017075	CGGCC	2	10	2051	2060	0 %	0 %	40 %	60 %	383755861
58	NC_017075	AGA	2	6	2074	2079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755861
59	NC_017075	CTA	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755861
60	NC_017075	GACGCT	2	12	2174	2185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383755861
61	NC_017075	TCG	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
62	NC_017075	TCG	3	9	2449	2457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
63	NC_017075	GCCGC	2	10	2458	2467	0 %	0 %	40 %	60 %	383755861
64	NC_017075	GCT	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
65	NC_017075	TGC	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
66	NC_017075	CGT	2	6	2560	2565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
67	NC_017075	ACCT	2	8	2646	2653	25 %	25 %	0 %	50 %	383755861
68	NC_017075	GCA	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755861
69	NC_017075	GC	3	6	2719	2724	0 %	0 %	50 %	50 %	383755861
70	NC_017075	CGT	2	6	2759	2764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755861
71	NC_017075	GCGG	2	8	2791	2798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017075	C	6	6	2838	2843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017075	C	6	6	2846	2851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_017075	G	6	6	2859	2864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017075	TTG	2	6	2872	2877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017075	CCG	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
77	NC_017075	AGC	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
78	NC_017075	CAC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755862
79	NC_017075	CGA	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
80	NC_017075	CGA	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
81	NC_017075	TCG	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
82	NC_017075	CGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
83	NC_017075	GAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
84	NC_017075	GCC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
85	NC_017075	CGG	2	6	3248	3253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755862
86	NC_017075	GGC	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755862
87	NC_017075	GGCGTG	2	12	3297	3308	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383755862
88	NC_017075	GCATC	2	10	3368	3377	20 %	20 %	20 %	40 %	383755862
89	NC_017075	TCG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
90	NC_017075	CGA	3	9	3497	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
91	NC_017075	ACG	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
92	NC_017075	AAC	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755862
93	NC_017075	TCG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
94	NC_017075	AGG	2	6	3616	3621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755862
95	NC_017075	CTTCGC	2	12	3626	3637	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383755862
96	NC_017075	CGG	2	6	3638	3643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755862
97	NC_017075	TCG	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
98	NC_017075	TCA	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755862
99	NC_017075	AAG	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755862
100	NC_017075	ACG	2	6	3738	3743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
101	NC_017075	CAA	2	6	3806	3811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755862
102	NC_017075	CGG	2	6	3827	3832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755862
103	NC_017075	CACC	2	8	3833	3840	25 %	0 %	0 %	75 %	383755862
104	NC_017075	GC	3	6	3851	3856	0 %	0 %	50 %	50 %	383755862
105	NC_017075	TCA	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755862
106	NC_017075	AAG	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755862
107	NC_017075	CGA	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
108	NC_017075	GGCCT	2	10	3948	3957	0 %	20 %	40 %	40 %	383755862
109	NC_017075	CCAG	2	8	3994	4001	25 %	0 %	25 %	50 %	383755862
110	NC_017075	GC	4	8	4031	4038	0 %	0 %	50 %	50 %	383755862
111	NC_017075	TCG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
112	NC_017075	GCC	2	6	4057	4062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
113	NC_017075	GCT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
114	NC_017075	ACG	2	6	4093	4098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755862
115	NC_017075	ATC	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755862
116	NC_017075	TCG	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
117	NC_017075	CGC	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
118	NC_017075	CG	3	6	4148	4153	0 %	0 %	50 %	50 %	383755862
119	NC_017075	GC	3	6	4158	4163	0 %	0 %	50 %	50 %	383755862
120	NC_017075	CGC	2	6	4173	4178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
121	NC_017075	TGG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755862
122	NC_017075	CCG	2	6	4276	4281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
123	NC_017075	GC	3	6	4362	4367	0 %	0 %	50 %	50 %	383755862
124	NC_017075	GCT	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
125	NC_017075	GGA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755862
126	NC_017075	ACC	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755862
127	NC_017075	CAT	4	12	4472	4483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755862
128	NC_017075	GCT	3	9	4520	4528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
129	NC_017075	CTT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755862
130	NC_017075	TGG	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755862
131	NC_017075	CTACAT	2	12	4571	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755862
132	NC_017075	GCC	2	6	4589	4594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755862
133	NC_017075	CTG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
134	NC_017075	TGC	2	6	4693	4698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755862
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163	NC_017075	ACGAAA	2	12	5519	5530	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_017075	CGC	2	6	5589	5594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755863
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222	NC_017075	GGA	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755866
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228	NC_017075	TCAGGA	2	12	8580	8591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383755867
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233	NC_017075	CGAG	2	8	8808	8815	25 %	0 %	50 %	25 %	383755867
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241	NC_017075	TCGA	2	8	9055	9062	25 %	25 %	25 %	25 %	383755867
242	NC_017075	GCCAA	2	10	9093	9102	40 %	0 %	20 %	40 %	383755867
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246	NC_017075	GCA	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_017075	CG	3	6	9407	9412	0 %	0 %	50 %	50 %	383755868
249	NC_017075	CTC	3	9	9435	9443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755868
250	NC_017075	TCG	2	6	9616	9621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755868
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258	NC_017075	CGC	2	6	10048	10053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755868
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260	NC_017075	GCG	2	6	10181	10186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755868
261	NC_017075	CGAG	2	8	10256	10263	25 %	0 %	50 %	25 %	383755868
262	NC_017075	GCCA	2	8	10273	10280	25 %	0 %	25 %	50 %	383755868
263	NC_017075	GGC	2	6	10378	10383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755868
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488	NC_017075	GC	4	8	17972	17979	0 %	0 %	50 %	50 %	383755874
489	NC_017075	CGA	2	6	17986	17991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755874
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497	NC_017075	GC	3	6	18259	18264	0 %	0 %	50 %	50 %	383755874
498	NC_017075	GC	3	6	18285	18290	0 %	0 %	50 %	50 %	383755874
499	NC_017075	GC	3	6	18433	18438	0 %	0 %	50 %	50 %	383755874
500	NC_017075	TCG	2	6	18453	18458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755874

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